真珠ができる過程で、真珠袋の細胞が真珠質を分泌する前に、有機質で核の表面を包む
場合もあります。

核から真珠の表面まで、6角形に結晶した真珠質（炭酸カルシウム）が層をなしています。
１枚の結晶の厚さは、0.4ミクロン前後です。
また、結晶と結晶との間には、結晶を接着する役目の蛋白質があります。
真珠は生きているアコヤ貝から採集するため、その真珠の表面は成長過程にあります。
その表面を顕微鏡で観察すると、成長過程にある真珠層が指紋に似た模様に見えます。

わたしたちが見ている真珠の色は、真珠層からはね返った干渉色です。